ファイルを簡単に編集する言語としてAWKという言語があります。これを使えば、Javaなんかだと何十行と書かないといけない操作でも、10行くらいで簡単に書けてしまいます。さくさくと処理してしまいたいときなどには便利な言語です。
http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/Hanasi/Algo/awk.html
詳細は上のURLを参照してほしいですが、これを使えばCSVファイルなどからデータを取り出して、各列の演算を一気にしてくれます。シェルの強力版として使えるようになると、作業が早くなるかもしれません。
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